Proyecto de Gabriela Munguía / Generación y visualización de bases nitrogenadas del maíz a partir de un programa en tiempo real de Processing

Gabriela Munguía
Bioarte & Tecnología

Generación y visualización de bases nitrogenadas del maíz a partir de un programa en tiempo real de Processing.

Existen 4 tipos distintos de agentes (bases nitrogenadas): Agente Adenina, Agente Citosina, Agente Timina y Agente Guanina. En base a una lectura de la secuencia completa del número de cada bases nitrogenadas de una secuencia de ADN se determina el número de cada agente que van a existir en el programa. Cada agente interactua entre sí con sus similares cuando se chocan y en base a esto genera lineas de unión entre ellos.

* Secuencia Completa del plasma mitocondrial (pBMSmt1.9): maíz, zea mays
Cantidad de Agentes: 1913
452 agentes de guanina (rojo)
586 agentes de adenina (morado)
486 agentes de timina (verde)
389 agentes de citosina (azul)

1 gggccctggc tttttgaagg aagagggtac ttcaagcccg ccctagcaat aggattgggt
61 tgcgcgtcca caccacacgg ctagtctgtt gactttttgt gccaggtgag aacagactat
121 cgggcgttag ctagagctga agcgaggggg agggtacatt ataaactagg gagcaagcag
181 cgctacctag gagaatttca gggtagccca atagataaaa tacagaaatc agctcttgga
241 tcaaactcaa ggcaaggtca gcttcctaag aaatagcggg cgttagcact ctacttagga
301 tcagaggatc cataagccat ttgccgaagg tttactacag gagttaaaga gatgggcgac
361 aagaaggcgg tcaccagctg ctaattatgg gccgtcccac gaccatttta gttgctgtcc
421 cctggcacta ccgggagggt gccatgccag gattcaacca tataaaggat ccgatcagtt
481 tgcaactggg cagggggact ggtataccta tgacgacgct ggctccatac cggacagaac
541 aacaggtatg aaaatcatcg tcaagaacaa tagatggatt ggagggattt atgagggagg
601 aagggaaaaa gcaaagcaag gaaaaaggca acagtagcag tttcacgatg tgcagaaatg
661 ccttctattt ttttttgcaa aataaaagaa aaaaaagaag caaaaaaaag aaaaccactg
721 gaagatcgag caacaagcta gtcatttact aaggagttgc tctctctact atttcctact
781 aatgaaaaca agtagaagat cgagcaacaa gctagtcatt taccaaggtg ttgctctctc
841 tactatctat ttactactac ttttgccttt taacggtacg gtaaggacaa gtgagttact
901 aaacaagtac tactacctta acggaccgga cctaataagc aaccattcct caagcgccgt
961 tccactcact acgggataca ctcctagagt agttggagca tatccctccg ttgcattcca
1021 ctattgatta cgatttccat acctgtccgg gaggtgaagc agaggaaggg cacccctcgt
1081 ctatacgata gggaatatat cgatagaaat atcgggaata gctcagttag ggtatgtgcg
1141 gagggagggc attcaattct atgtgcaacg gaaagggatg tattacctgt tcataacagc
1201 aatggaatac ctattcatat agttatatat atctacttat ttatatctac ttatttatat
1261 ctattgattt atatctactt atttagggtg gcctccacta tcgttccggt cttacctacc
1321 ctcgagtccg atctcgggta ggcgcttagg caaggttaga ataagaaggg ccattccaat
1381 aataagattg gccattccaa cattgggcaa tcataaatat tgtataatgg tgaccgagat
1441 cacccattgg aaatctgtat ttctaatttg ttgggggata ctaggcgtat gaactagtat
1501 ctatgcagtg ggaactatat cagacagtta ttcaaaaatg tacctgaaca ccaatagtac
1561 gttggagaac gttgcttcga ccaggattac tatcttcgat ctgaaactct gataagcaga
1621 attgaagaca aacgatcggg tacttgggga atatggaatt tatttactgt tggtttacct
1681 agtacttgcc taccagccag gcgccccagg ggacgacggc aaagatacag tctcgggtat
1741 taggatggca aaggcagcga tagataaatt ctactccaag tatatgttgg gatcacgtaa
1801 gctggtgctt gacccacatt caacgatctt tggcaaaagg atgcttgtca aaagtgcgat
1861 catgtgctat tccaataaca caagatagat cagtcctcga ggaaggtcta cag
Visualización animación:
http://www.youtube.com/watch?v=vpD86w5IDWw

2 Responses to “Proyecto de Gabriela Munguía / Generación y visualización de bases nitrogenadas del maíz a partir de un programa en tiempo real de Processing”

  1. 4 Jan 2012 at 10:38 pm Gabriela Munguía
    reply

    Saludos Marce y muchas gracias por poner mi trabajo. Felíz año y seguimos en contácto. Avisame cuando vuelvas a Argentina. Un beso y un abrazo grande.

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